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Bordeaux Imaging Center

Le BIC (Bordeaux Imaging Center) réunit des ressources en imagerie photonique et en imagerie électronique, principalement dans les domaines de la santé et du végétal. C'est une plateforme labélisée au niveau national Infrastructure en Biologie Santé et Agronomie (IBISA). C'est une unité de service labélisée par le CNRS, l'INSERM et l'Université Bordeaux Segalen. Le BIC est le pôle imagerie du Centre de Génomique Fonctionnelle de Bordeaux.
Les différentes composantes du BIC sont :

  • le Pôle d'Imagerie photonique,
  • le Pôle d'Imagerie électronique,
  • le Pôle d'Imagerie du végétal.

Le Bordeaux Imaging Center offre l'accès aux techniques les plus avancées de bio-imagerie telles que la vidéo-microscopie, la microscopie confocale, la microscopie multiphoton, la microscopie électronique à transmission et la microscopie électronique à balayage. Il dispose également d'un ensemble d'équipements haut de gamme pour la microscopie à très haute résolution telle que la microscopie confocale STED et la microscopie PALM, la vidéo-microscopie FRAP, la microscopie de temps de vie de fluorescence FLIM pour les mesures d'interactions moléculaires. Il met par ailleurs à disposition un ensemble d'équipements pour la préparation d'échantillons, tels que l'ultra-microtome, la congélation à haute pression (HPF) et l'accueil d'échantillons vivants. (infos page d’accueil)

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Le Bordeaux Imaging Center offre l'accès aux techniques les plus avancées de bio-imagerie telles que la video-microscopie, la microscopie confocale, la microscopie multiphoton, la microscopie électronique à transmission et la microscopie électronique à balayage.

Le BIC dispose également d'un ensemble d'équipements haut de gamme pour la microscopie à très haute résolution telle que la microscopie confocale STED, la video-microscopie FRAP, la microscopie de temps de vie de fluorescence FLIM pour les mesures d'interactions moléculaires.

Nous mettons par ailleurs à disposition un ensemble d'équipements pour la préparation d'échantillons, tels que l'ultra-microtome, la congélation à haute pression (HPF) et l'accueil d'échantillons vivants.

>> Pour plus de détails, consulter le site du BIC.

Partenariats

Partenaires scientifiques :
  • Fédération Bordeaux Neurosciences (SFR),
  • Fondation pour la recherche médicale,
  • Société française de Microscopies,
  • GDR2588 Microscopie fonctionnelle du vivant,
  • Réseau technologique de vidéo-microscopie, microscopie confocale et microscopie résolue en temps,
  • UMR 5798 LOMA - Laboratoire Ondes et Matière d’Aquitaine, LP2N -
  • Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences ImagoSeine,
  • UMR 5297 IINS - Institut interdisciplinaire de neurosciences, Institut Curie.
Partenaires industriels :
  • Amplitude Systèmes,
  • Roper Scientific,
  • Photometrics,
  • Princeton Instruments,
  • Nikon Instruments,
  • Leica Microsystems,
  • Errol.
Partenaires institutionnels :
Implications dans les réseaux nationaux et internationaux :
  • Euro Bio-Imaging,
  • France Bio-Imaging,
  • Réseau Technologique Microscopie Photonique de Fluorescence Multidimensionnelle (RT mfm),
  • GDR2588,
  • Réseau technologique des Centres Communs de Microscopie Électronique (RCCM),
  • Réseau des Microscopistes de l’INRA.

Informations complémentaires

Service:
  • Mise à disposition des équipements aux utilisateurs
  • Formations des utilisateurs sur les équipements
  • Formations continues avec plusieurs sessions par an :
  • microscopie, traitement et analyse d’images
  • Prises en charge de projets de la préparation des échantillons
  • à l’analyse des données

Développement technologiques / méthodologiques:
  • Développement de nouvelles méthodes de « nano-imaging » à différentes échelles spatiales et temporelles
  • Real-time imaging à très haute résolution
  • Stratégies d’analyse d’images à haut volume et haut débit
  • Microscopie corrélative : couplage des technique de très haute résolution en photonique et ultrastructure en électronique
  • Développement des techniques de cryométhodes

Savoirs faire:
  • Microscopie photonique à ultra-haute résolution : STED et PALM
  • Mesure des durées de vie de fluorescence (FLIM) permettant les mesures des interactions protéiques in vivo (FRET)
  • Technique de FRAP permettant les études de diffusion des molécules
  • Microscopie confocale à balayage ou par spinning-disk, multiphotonique
  • Différentes techniques de préparation des échantillons pour la microscopie électronique des méthodes conventionnelles aux cryo-méthodes
  • Cryo-ultra microtomie : Tokuyasu et Cemovis
  • Observation en mode environnemental au MEB
  • Microscopie corrélative
  • Tomographie électronique
  • Traitement et analyse d’images 2D ou 3D à l’aide des logiciels : Metamorph, Imaris, ImageJ, AutoQuant, Image Pro plus, Amira, etomo...

Formations organisées par le BIC (voir le site web du BIC pour détails):
  • Epifluorescence and confocal microscopy (3 days): The perfect training for beginners in microscopy
  • Advanced microscopy (5 days): For people who already know basics in microscopy
  • MetaMorph (2 levels – 3 days): Basics of image treatment and analysis with MetaMorph software
  • MetaMorph Advanced (3 days): For users who need to develop journals for automation of analysis
  • FRAP and SPT (3 days) 2325 October : For a specialization on FRAP and Single Particles Tracking techniques
  • Superresolution microscopy (3 days)

Formations associées:

 

Consulter les fiches des enseignants-chercheurs de l'équipe:

Daniel Choquet

Contacts

Responsable(s)
Daniel Choquet
Marc Landry, directeur adjoint; Patrick Moreau, directeur adjoint

Coordonnées

Tél. 05 57 57 40 90 / 83
Fax. 05 57 57 40 82

Site web : http://www.bic.u-bordeaux2.fr/

Adresse : Institut François Magendie 146 rue Léo Saignat
33076 Bordeaux cedex

Site géographique : Carreire

Rattachements

Centre de génomique fonctionnelle de Bordeaux

SFR : Infrastructures

Organigramme

Organigramme de la structureTélécharger

Chiffres-clés

  • 3 composantes : pôle d’imagerie photonique, d’imagerie électronique, d’imagerie du végétal.
  • 20 personnes dont 14 ingénieurs au service de la communauté scientifique
  • 6 stations d’analyse d’image
  • 5 systèmes de préparation d’échantillons
  • 15 systèmes d’imagerie photonique dont 2 pour la super résolution
  • Plus de 250 utilisateurs/an
  • 4 microscopes électroniques
  • Plus de 200 personnes formées par an
  • Contribution à + de 100 publications/an